في هذا الوباء تم ختم المرضى لتمييزهم، ولم تنقطع الأوبئة عن لندن بعد الموت الأسود، فقد عاود الطاعون الظهور مرة كل 10 سنوات تقريبًا من عام 1348 إلى 1665 وكان هناك تفشيًا خلال ما يزيد قليلاً عن 300 عام ومع كل وباء طاعون جديد، قُتل 20 % من الرجال والنساء والأطفال الذين يعيشون في العاصمة البريطانية.
وبحلول أوائل القرن السادس عشر، فرضت إنجلترا القوانين الأولى لفصل وعزل المرضى وتم تمييز المنازل التي أصابها الطاعون بحزمة من القش معلقة على عمود بالخارج فإذا كنت قد أصبت بأفراد من عائلتك، كان عليك حمل عمود أبيض عندما تخرج في الأماكن العامة ويُعتقد أن القطط والكلاب تحمل المرض، لذلك كانت هناك مذبحة جماعية لمئات الآلاف من الحيوانات.
وكان الطاعون العظيم عام 1665 هو الأخير والأسوأ من تفشي المرض على مدى قرون، حيث قتل 100000 من سكان لندن في سبعة أشهر فقط وتم حظر جميع وسائل الترفيه العامة وتم إغلاق الضحايا بالقوة في منازلهم لمنع انتشار المرض، وعلى الرغم من قسوة إسكات المرضى في منازلهم ودفن الموتى في مقابر جماعية، إلا أنها كانت هذه هي الطريقة الوحيدة لإنهاء تفشي الطاعون العظيم الأخير.