قدرة الهيكل على الحماية الدائمة للحيوان.
الوزن.
التدعيم.
مدى الحركة.
الحجم.
يمكن المقارنة بين الحيوانات ذو الهياكل الداخلية والخارجية من حيث:
قدرة الهيكل على الحماية الدائمة للحيوان: يتميز الهيكل الداخي بقدرته على تدعيم جسد الحيوان بشكل دائم، حيث ينمو الهيكل الداخلي كنسيج حي داخل الجسم مع نمو الكائن الحي من الطفولة إلى البلوغ، دون الحاج إلى عملية الإنسلاخ لتكوين هيكل جديد، فيستمر جسد الحيوان مدعومًا طوال فترة حياته محميًا ضد الهجمات الخارجية.
بينما تلجأ الحيوانات ذو الهيكل الخارجي إلى عملية الإنسلاخ للتخلص من الهيكل القديم عند الإنتقال من مرحلة إلى اخري مثل الإنتقال من مرحلة الطفولة إلى البلوغ مما يجعل الجسم ضعيفًا وعُرضة للهجمات الخارجية حتى تكون الهيكل الجديد.
الوزن:الهياكل الداخلية أخف وزنًا من شبيهتها الهياكل الخارجية.
التدعيم: الهياكل الداخلية لها القدرة على دعم أوزان أكبر من الهياكل الخارجية، مما يساعد على نمو الكائنات اللافقارية إلى أحجام اكبر من شبيهتها ذو الهيكل الداخلي مثل الحشرات.
مدى الحركة: مما يميز الهيكل الخارجي عن الداخلي هو المدي الواسع للحركة، حيث تتصل العضلات بمساحة أكبر من الهيكل اتصال مباشر بالجزء الداخلي منه، مما يسمح بالقوة والحركة القوية ومساحة واسعة من الحركة.
وفي حالة الهياكل الداخلية ترتبط العضلات بالهيكل من خلال أربطة وأوتار، مما يقلل مدي الإتصال وبالتالي مدي قوة وسعة الحركة.
الحجم: تتميز اللافقاريات ذو الهيكل الخارجي بصغر الحجم مقارنة بذو الهيكل الداخلي، فيساعد الوزن الخفيف للهيكل الداخلي على نمو الكائن الحي كبيرًا مقارنة بذو الهيكل الخارجي ذو الوزن الأثقل نسبيا، مثل مقارنة الحشرات ذو الهيك الخارجي بنجم البحر ذو الهيكل الداخلي