تنشأ أعراض مرض البلهارسيا نتيجة تفاعل الجسم مع البيض الذي تنتجه الديدان وليس من خلال الديدان نفسها، ولكن غالبية الأشخاص لا تظهر عليهم الأعراض في تلك المرحلة المبكرة من العدوى، ولكن في خلال أيام قليلة بعد الإصابة بالعدوى، من الممكن أن تظهر أعرض مثل:

الطفح الجلدي أو حكة في الجلد.
من الممكن أن تبدأ الحمى والقشعريرة والسعال وآلام العضلات في خلال شهر إلى شهرين من الإصابة.
عند وجود الديدان البالغة تنتقل البويضات التي يتم إنتاجها في الغالب إلى الأمعاء أو الكبد أو المثانة، وبالتالي تسبب التهابًا أو تندبًا، كما يمكن للأطفال المصابون بالعدوى أن يتعرضوا بصورة متكررة إلى فقر الدم وسوء التغذية وصعوبات في التعلم.
بعد سنوات من العدوى من الممكن للطفيلي كذلك أن يتسبب في تلف الكبد والأمعاء والرئتين والمثانة، من النادر جدًا أن تتواجد البويضات في المخ أو النخاع الشوكي ومن الممكن أن تسبب نوبات، شللًا، التهابًا في النخاع الشوكي.