قد تحتوي العديد من أعراض طفيليات الجهاز الهضمي عند الأطفال على أعراض أمراض أخرى، ولتشخيص المشكلة بدقة، قد يصف الطبيب العديد من الإجراءات ومنها:

تصوير البطن بالموجات فوق الصوتية لالتقاط الجسم المتحرك لعدوى الديدان المعوية.
اختبر عينات تحت أظافر الأصابع لتشخيص الجراثيم والديدان.
قد يصف الأطباء فحص البراز للكشف عن الديدان.
كما يُنصح بفحص فتحة الشرج لدى الطفل تحت ضوء المصباح ليلاً.
يحدد الأطباء العلاج الفعلي ويبدأونه بعد وقت قصير من كل التشخيصات.