تعتبر الديدان الأسطوانية أكثر تعقيداً من الديدان المفلطحة وذلك بسبب وجود

هضمية بفتحتين . وإليك الاختلافات بين الديدان الاسطوانية والديدان المفلطحة:
من حيث الشكل : الديدان المفلطحة لها جسم رقيق ومسطح أما الديدان الاسطوانية فلها جسم اسطواني طويل وغير مقسم وبدون زوائد جانبية.
من حيث التجويف : الديدان المفلطحة ليس لها تجويف في الجسم أما الديدان الاسطوانية فلها جزيئات كاذبة وبالتالي لها تجويف.
من حيث القناة الهضمية : الديدان المفلطحة لديها قناة هضمية غير مكتملة أما الديدان الاسطوانية فلديها قناة هضمية كاملة ومستقيمة والأمعاء غير عضلية.
من حيث نوع الجنس : الديدان المفلطحة في الغالب تكون خنثى أما الديدان الاسطوانية فهي ثنائية الجنس.
من أمثلتها : الديدان المفلطحة مثل الدودة الشريطية وتسمى أيضاً المتورقة الكبدية أو كبد الأغنام وذلك لأنها طفيل للقناة الصفراوية في الأغنام أما من أمثلة الديدان الاسطوانية دودة الفيلاريا وهي طفيل للقولون في الأطفال ومن الديدان الاسطوانية المعروفة أيضاً الدودة السوطية