تغير المُناخ.
المحيطات الحمضية.
ابيضاض المرجان.
مصادر تلوث البرية.
التأثيرات الجسدية.
تغير المُناخ: من أكبر التهديدات التي تتعرض لها الشعب المرجان؛ بسبب ارتفاع درجات الحرارة هي بياض المرجان والأمراض المعدية، ويتغير مناخ البحر مثل ارتفاع مستوى سطح الماء؛ وحدوث العواصف الاستوائية وتغير أنماط دوران المحيطات.
المحيطات الحمضية: عندما يتم امتصاص ثاني أكسيد الكربون في المحيط من الغلاف الجوي؛ يحدث زيادة في حموضة ماء البحر؛ مما يسبب ذوبان أصداف كائنات المحيط مثل الشعب المرجانية، ويصعب إعادة بنائها وتصبح شديدة الهشاشة ولا تستطيع حماية المُعيلين لها.
ابيضاض المرجان: لا تستطيع الطحالب تحمل درجات الحرارة المرتفعة؛ مما يدفعها للخروج من على الشعب المرجانية، فيصعب إنتاج الغذاء وتصبح لونها أبيض شفاف، والشعاب المرجانية لا تستطيع أن تعيش مدة طويلة دون الغذاء الذي تحصل عليه من الطحالب وبذلك تتعرض للخطر الشديد.
مصادر تلوث البرية: تهدد مصادر التلوث البرية مثل الجريان السطحي والرواسب والصرف الصحي والمغذيات بتلوث المياه، وعدم قدرة الشعب المرجانية على تنقيتها مرة اخرى، فيحدث اختناق للطحالب وانتشار الأمراض وانخفاض الأكسجين و تدهور وتلف الشعب المرجانية.
التأثيرات الجسدية: تقترب الشعب المرجانية من سطح المحيط؛ مما يعرضها للتأثر بمخاطر هبوط السفن والعواصف وتلف المراسي، وتتسبب هذه المخاطر في خسائر كثيرة.
الأنواع الأصلية: العلاقة التكافلية بين الشعب المرجانية والعديد من أنواع الأسماك؛ حيث توفر لهم الشعب المرجانية مكان للعوائل ويوفر العوائل الغذاء للشعب المرجانية، فمثلًا مكان تواجد الشعب المرجانية يوفر للطحالب ضوء الشمس؛ ليقوم بعملية التمثيل الغذائي، كذلك تعطي الطحالب اللون الذي يجذب السياح إلى الشعب المرجانية، وأي فساد يحدث للشعب المرجانية قد يؤدي إلى تدهور النظام البيئي وفقدان الكثير من الكائنات.