يستغرق خلع ضرس العقل حوالي من 10-15 دقيقة إذا كان الضرس ظاهر ، أما في حين كان الضرس مدفون فيستغرف من 30-45 دقيقة، فإذا لم يخترق السن اللثة ، فسيتم عمل قطع صغير (شق) في اللثة للوصول إليها ، قد تحتاج أيضًا إلى إزالة قطعة صغيرة من العظم الذي يغطي السن ، يمكن أن يقوم الطبيب بتقطيع ضرس العقل إلى أجزاء أصغر ، حتى يتمكن من إزالته من خلال الفتحة الصغيرة التي قام بشقها.
من الممكن أن تحس بوجود بعض الضغط على الأسنان ، وذلك لأن طبيب الأسنان يقوم بتوسيع مكان السن وذلك من خلال لخلخته في اتجاه منعكس لخلعه ، ويختلف الوقت التي يتم فيه عملية خلع ضرس العقل ، فيمكن أن تكون مدة إزالة الضرس عدة دقائق إلى عشرين دقيقة إذا كانت العملية صعبة ، بعد جراحة إزالة ضرس العقل يقوم الطبيب المعالج إذا تم إجراء شق في اللثة ، يقوم باستخدام الغرز المذابة حتى يقوم بإغلاق اللثة ، سيخبرك طبيب الأسنان الخاص بك بالوقت الذي تستغرقه الغرز لتذوب (وعادة ما تستغرق من 7 إلى 10 أيام).
قد يضع طبيب الأسنان بعض قطع الشاش على موقع ضرس العقل الذي قام بخلعه ، ويطلب من المريض الاستمرار في الضغط عليه عن طريق القضم ، وهذا للسماح بتكوين جلطة دموية في محجر الأسنان الفارغ ، تشكل جلطات الدم جزءًا من عملية الشفاء.